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activemotif -ATAC-Seq試劑盒
產(chǎn)品時間：2022-12-20
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ATAC-Seq試劑盒
Assay for Transposase-Accessible Chromatin 通常簡稱為ATAC-Seq。ATAC-Seq方法依賴于使用超活性轉(zhuǎn)座酶Tn5構(gòu)建二代測序（NGS）文庫。NGS測序所需的adapter被預(yù)加載到了Tn5轉(zhuǎn)座酶上，這允許染色質(zhì)片段化和adapter的連接同步進(jìn)行，生成的DNA文庫可以通過NGS進(jìn)行測序，并使用生物信息學(xué)分析具有開放或可及染色質(zhì)的基因組區(qū)域。
與其它技術(shù)（如FAIRE-Seq或DNase-Seq）相比，ATAC-Seq的主要優(yōu)勢在于檢測所需的細(xì)胞數(shù)量較少，且實(shí)驗(yàn)方法相對簡單。
ATAC-Seq實(shí)驗(yàn)一般只需要大約50000個細(xì)胞作為起始材料，并且由于其相對較簡單的兩步法實(shí)驗(yàn)步驟，使得它成為了開啟表觀研究的常用方法。無論您是想分析樣本中染色質(zhì)的狀態(tài)，還是比較特殊處理前后的染色質(zhì)狀態(tài)，ATAC-Seq都可以幫您研究全基因組染色質(zhì)的變化，并可以為后續(xù)實(shí)驗(yàn)中應(yīng)該研究哪種表觀遺傳修飾或轉(zhuǎn)錄因子以及應(yīng)該使用哪種方法來研究它們提供指導(dǎo)。
ATAC-Seq試劑盒
在全基因組范圍內(nèi)分析開放的染色質(zhì)區(qū)域。
ATAC-Seq試劑盒總覽
名稱格式貓?zhí)枴r格 ATAC-Seq 試劑盒16 rxns 5315015,600購買尋找批量重組 Tn5轉(zhuǎn)座酶？引用一下。需要復(fù)用16個以上的樣品嗎？參見我們的 NexteraTM 兼容多重引物(96復(fù))。
ATAC-Seq是一種快速檢測方法，可通過識別具有開放或可及狀態(tài)的染色質(zhì)區(qū)域來分析整個基因組的表觀遺傳概況。ATAC-Seq方法快速，簡便，適用于廣泛的樣品類型，已成為常用的表觀遺傳學(xué)分析方法，并且可以作為更深入的表觀遺傳學(xué)分析的基礎(chǔ)。
在ATAC-Seq實(shí)驗(yàn)中，用高活性的突變Tn5轉(zhuǎn)座酶處理來自細(xì)胞或組織樣品的完整細(xì)胞核。該轉(zhuǎn)座酶把DNA片段化的同時用測序接頭標(biāo)記靶DNA。
Active Motif的ATAC-Seq試劑盒提供了與Illumina®平臺兼容的ATAC-Seq文庫制備試劑，可以從20 – 30 mg組織或50,000 – 100,000個細(xì)胞中生成16種不同的ATAC-Seq文庫。經(jīng)過優(yōu)化的方案將指導(dǎo)您完成樣品制備、DNA片段標(biāo)記和文庫構(gòu)建的步驟，構(gòu)建可在單個測序反應(yīng)中進(jìn)行多重測序的文庫。
ATAC-Seq試劑盒亮點(diǎn)
顯示開放染色質(zhì)區(qū)域的基因組序列
僅需數(shù)小時即可完成NGS文庫制備
簡單，快速的實(shí)驗(yàn)步驟與優(yōu)化的試劑
ATAC-Seq試劑盒組分
ATAC-Seq試劑盒包含兩盒組分，其中-20°C保存的一盒組分干冰運(yùn)輸，4°C保存的另一盒組分室溫運(yùn)輸。次使用后，請根據(jù)說明書中的存放條件保存。妥善保管的試劑自收貨之日起可穩(wěn)定保存6個月。
試劑包括
ATAC 裂解緩沖液，存儲在 RT 組裝的轉(zhuǎn)座體中，存儲在 -20 ° C 2X 標(biāo)記緩沖液中，存儲在 -20 ° C 1X 標(biāo)記緩沖液中，存儲在 -20 ° C 或 RT10X 標(biāo)記緩沖液中，存儲在 RT10% 吐溫20，存儲在 RT1% 數(shù)字蛋白,存儲在 -20 ° C DNA 純化柱，存儲在 RTDNA 純化結(jié)合緩沖區(qū)，存儲在 RTDNA 純化洗滌緩沖區(qū)，存儲在 RTDNA 純化洗脫緩沖區(qū)，存儲在 RT3M 醋酸鈉，存儲在 RT10mM dNTP，存儲在 -20 ° C 5X Q5緩沖區(qū)，存儲在 -20 ° C Q5高保真 DNA 聚合酶,儲存在 -20 ° C i7索引引物1，儲存在 -20 ° C i7索引引物2，儲存在 -20 ° C i7索引引物3，儲存在 -20 ° C i7索引引引物4，儲存在 -20 ° C i5索引引物1，儲存在 -20 ° C i5索引引物2，儲存在 -20 ° C i5索引引引物3，儲存在 -20 ° C i5索引引引物4，儲存在 -20 ° C SPRI 珠，儲存在4 ° C
ATAC-Seq試劑盒數(shù)據(jù)
ATAC-Seq試劑盒包含進(jìn)行16個ATAC-Seq反應(yīng)所需的試劑和酶。這些試劑盒組分經(jīng)過優(yōu)化，可以高效工作，經(jīng)驗(yàn)證可以生成高質(zhì)量的ATAC-Seq數(shù)據(jù)。
揭示啟動子處染色質(zhì)的開放位置
具有轉(zhuǎn)錄活性的基因，其啟動子處的染色質(zhì)通常是開放的或可及的。ATAC-Seq分析會在這些位置產(chǎn)生峰，揭示正在研究的樣品中開放的染色質(zhì)區(qū)域。
圖1：ATAC-Seq試劑盒實(shí)驗(yàn)結(jié)果展示在基因組瀏覽器中。ATAC-Seq試劑盒用于評估小鼠腦組織樣品的全基因組開放染色質(zhì)狀態(tài)。此處顯示的基因組瀏覽器軌跡位于FOXP3基因位置，該基因編碼有絲分裂后神經(jīng)元的生物標(biāo)記物。峰表明在FOXP3基因的啟動子上有開放的染色質(zhì)。
試劑盒實(shí)驗(yàn)結(jié)果與已發(fā)表數(shù)據(jù)高度相關(guān)
Active Motif的ATAC-Seq試劑盒可生成高質(zhì)量數(shù)據(jù)。使用ATAC-Seq試劑盒產(chǎn)生的ATAC-Seq數(shù)據(jù)與已發(fā)表的ATAC-Seq數(shù)據(jù)具有很好的相關(guān)性，這突出說明了該檢測方法的可靠性和可重復(fù)性。
ATAC-Seq RKPM Data
圖2：ATAC-Seq試劑盒文庫與已發(fā)表的ATAC-Seq數(shù)據(jù)集的相關(guān)性。該圖顯示了在GM12878細(xì)胞中，已發(fā)表的ATAC-Seq(Buenrostro, J. D. et al. (2013) Nat. Methods 10: 1213-1218)數(shù)據(jù)的峰中的RPKM信號與使用試劑盒生成的數(shù)據(jù)集之間的相關(guān)性為0.94。
北京華新康信也有Activemotif實(shí)驗(yàn)試劑銷售，下面給大家講講Activemotif服務(wù)以及實(shí)驗(yàn)樣本；Moltox ForteBio Moltox ForteBio Moltox ForteBio Moltox ForteBio Moltox ForteBio Toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin toxin Activemotif實(shí)驗(yàn) Activemotif試劑 Activemotif說明 Activemotif試劑方案Activemotif實(shí)驗(yàn)說明 Activemotif說明書 Activemotif技術(shù)參數(shù) Activemotif方案對比 Activemotif介紹 Activemotif廣州試劑 Activemotif深圳試劑Activemotif說明書 Activemotif技術(shù)參數(shù)Activemotif實(shí)驗(yàn)方案Activemotif技術(shù)對比Activemotif購買說明 Activemotif江蘇試劑 Activemotif北京試劑Activemotif廈門試劑Activemotif大理試劑Activemotif武漢試劑Activemotif福建試劑Activemotif安徽試劑Activemotif廣西試劑Activemotif廈門試劑Activemotif常州試劑Activemotif安徽試劑Activemotif長沙試劑Activemotif哈爾濱試劑Activemotif沈陽試劑Activemotif深圳試劑Activemotif武昌試劑Activemotif湖北試劑Activemotif湖南試劑Activemotif上海試劑Activemotif ForteBio實(shí)驗(yàn)試劑，moltox實(shí)驗(yàn)試劑，toxin實(shí)驗(yàn)試劑，ForteBio moltox toxin 各種試劑的實(shí)驗(yàn)參數(shù)，說明書，歡迎咨詢 Activemotif試劑介紹 Activemotif試劑介紹 Activemotif研究方案
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